同時，在科學省中，科學家們也注意到了這場騷動……

　　「不好了，整個電算市竟然被包圍在次元區域中，整個電算網路區域２被實體化！」「什麼，想不到連網路空間都可以實體化……」

　　科學省的電視牆正顯示著電算市各地病毒攻擊事件的災情，在病毒的破壞下每個地方的建築物都冒出了黑煙與大火，民眾以及實體化的領航員有如螞蟻般不斷逃難，求救電話也如蜂湧般灌進科學省中，真是慘不人睹……

　　「這難道又是……利、利卡爾博士搞得鬼！」莫古斯教授咬牙說道。

　　「不，根據地圖顯示，次元轉換空間是由ＩＰＣ的總電腦發射出來的！」名人說道。

　　「What! IPC, It`s Mr.Enzan`s company!」帶廣喊道。

　　「總而言之，大家快點啟動科學省的安全模式！」祐一朗指示道。

　　「緊急連絡網路救世主(Net Savior)和伊集院炎山！」

 

　　站在ＩＰＣ大門口前的熱斗一行人，這回可被實體化的小矮兵包圍，正面對著被攻擊的危機。由於電子次元轉換的關係，電算市與電腦世界重疊，各種存在於電腦世界的病毒全都在電算市中大鬧。

　　「病毒，這下該怎麼辦的嘛，這下該怎麼辦的嘛！」日暮抱著頭慌張地大叫。

　　「炎山主人！」

　　「熱斗，雖然已經很久沒碰過了，但是我們得用『交互融合(Cross Fusion)』對付病毒才行！」洛克提示熱斗道。梅兒聽洛克這麼一說，也從背包中拿出了同步用的晶片。

　　「交互融合……可是？」「梅兒，我想我們一定也能做到！」

　　交互融合，就是一種網路領航員藉由操作者的身體為媒介，在電子次元區域中與操作者同步實體化的方式，同步的要素在於領航員與操作者之間的羈絆，若兩人羈絆越高，那麼同步的效果就會越大。

　　「可是，交互融合所需要的『同步晶片』我已經交給爸爸去修理了耶！」熱斗這下子才想到他手中根本沒有同步晶片。

　　「去，真拿你們辦法！」一旁的炎山，無奈的將一張藍色外殼的晶片－同步晶片丟給熱斗。「拿去用吧！」

　　「謝謝你，炎山！」「別謝了，聽起來會很噁心的！」

　　「熱斗！」洛克提醒道。「交互融合前必須先將晶片插入到ＰＥＴ中，這樣子戰鬥中才不會缺少武器。」

　　熱斗遵照洛克的指示，將三十張晶片插入ＰＥＴ中，準備完成……

 

　　「Ｓｙｎｃｈｒｏ　Ｃｈｉｐ，ｓｌｏｔ　ｉｎ（同步晶片，插入）！」

 

　　「ＣＲＯＳＳ　ＦＵＳＩＯＮ（交互融合）───」

　　熱斗、梅兒、炎山將同步晶片插入ＰＥＴ中，ＰＥＴ的螢幕上立刻顯現出一個六角形晶體的圖形，耀眼的白色光芒隨即包圍住三個人。一片片領航員的資料包裹住操作者的身體，轉眼間，操作者的外貌成功轉變成了領航員的型態了。

 

　　交互融合，完成！

 

　　「太好了，交互融合的能力還是沒有退步！」變成洛克人型態的熱斗驚喜的看著自己的手。

　　「現在可不是驚訝的時候了，要開始了！」布魯斯型態的炎山的右腕亮出劍來，準備對襲來的病毒發動攻擊。「對戰晶片，音波劍！」

　　布魯斯以音速小子般的速度向前衝刺，斬斷所以包圍他們的小矮兵，殺出一條路逃生。

　　「對戰晶片，散彈槍！」「對戰晶片，颶風！」

　　洛克人型態的熱斗和蘿露型態的梅兒，也使用對戰晶片，對四周襲來的病毒群發動攻擊。很快地，三個人總算將包圍他們的病毒清光了。

　　「太漂亮了的嘛！」一旁的日暮先生拍手讚嘆道。不過沒有人理他……

 

　　「伊集院、光，你們聽的到嗎？」熱斗和炎山的頭盔中，都傳出了名人的聲音。

「ＩＰＣ公司發生什麼事了？」

　　「ＩＰＣ的主電腦遭人侵入，電子次元轉換裝置落入了敵人手中……」炎山回答道。「全部交給我處理吧，完畢！」

　　炎山不等名人的回應，就取消了通訊。

 

　　儘管在最混亂的時刻，記者們仍為了自己的工作，在直昇機上賣力地報導著……

　　「綠川可實況報導，這實在是一個難得一見的奇景，所有電腦世界的病毒竟然都實體化，出現在整個電算市中，這到底是怎麼回事呢？目前根據相關人士表示，是電子轉換系統遭人控制的關係……現在，由畫面中可以看到，除了成群的病毒在街道與建築物上徘徊外，目前……」

　　記者綠川還沒有說完，直昇機的下方，竟然就出現了一個似乎是由灰色泥巴捏成的圓球所生成，約有八層樓高，擁有四肢的巨大怪物……

　　「這是怎麼回事，現在直昇機的下方，竟然出現了一個奇怪的怪物，這個東西，難道也是病毒？」

 

　　「那是……刪除人(Deleteman)！！！」正位於忙成一團的警視廳的織田警官凝視著螢幕上，那個巨大的灰色怪物叫道。

　　「刪除人，那是什麼？」一旁的人員對著這個名詞詢問道。

　　「那是網路廢棄資料處理場的處理領航員，負責消化所有的廢棄資料。可是，我不懂，就算刪除人實體化，他的大小應該也不會變成這麼大才對。」

　　話才說到這裡，病毒竟然已經開始進攻警視廳，成群的蜜蜂型病毒飛了進來，把織田警官的帽子刮走，全部的人員嚇得四處逃竄。

　　「各位冷靜下來，出動警備網路領航員！」織田警官拿起麥克風開始下令，指示全員對付實體化的病毒。

 

　　某棟建築物的頂樓，一名穿著白色研究服的神秘男子正微笑的看著這場大亂，並且拿起他的ＰＥＴ準備打電話……

　　「Ainamk大人，我們已經控制住了ＩＰＣ的主電腦了，很快的目標程式就可以下載完畢了！」這名戴著眼鏡的男子報告道。

　　「很好，你做的不錯，Remiel博士。」ＰＥＴ線路的另一端，傳來了一個冰冷的聲音。

　　「可是，洛克人和布魯斯似乎擁有防盜裝置保護，導致我沒辦法直接取得他們的靈魂程式！」

　　「哼，光祐一朗果然是個天才。沒關係，由我來處理，我會再下達指令的，現在只要做好你的工作就行了！」

　　「遵命！」